我が家も二つの部屋が繋がっていて、二台のエアコンがあります。
同じメーカーのエアコンですと、リモコンの赤外線も同じになっているので
よりeRemote miniに近い方のエアコンが作動してしまうのだと思います。（我が家も同じでした）
同じ部屋にあるエアコンを使い分けたい場合は
最低でもeRemote miniが2台必要なようです。
（指示が届く範囲内であればAlexaは1台でOKです）
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